Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUCB2P80303 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUCB2P80303 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms