Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3S2P59780 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms