Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBASH3AP57075 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms