Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX17P56962 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX17P56962 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STX17P56962 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STX17P56962 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX17P56962 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX17P56962 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX17P56962 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX17P56962 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms