Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MTTPP55157 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTTPP55157 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTTPP55157 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTTPP55157 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTTPP55157 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTTPP55157 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTTPP55157 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTTPP55157 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTTPP55157 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTTPP55157 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTTPP55157 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MTTPP55157 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MTTPP55157 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTTPP55157 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTTPP55157 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTTPP55157 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MTTPP55157 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTTPP55157 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTTPP55157 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTTPP55157 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTTPP55157 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTTPP55157 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms