Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP1B3P54709 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP1B3P54709 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms