Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACLYP53396 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACLYP53396 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACLYP53396 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACLYP53396 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACLYP53396 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACLYP53396 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACLYP53396 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACLYP53396 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms