Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LUMP51884 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LUMP51884 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LUMP51884 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LUMP51884 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LUMP51884 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms