Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA2P51587 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRCA2P51587 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms