Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB5CP51148 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms