Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ETV1P50549 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ETV1P50549 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ETV1P50549 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms