Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXP28300 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXP28300 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXP28300 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXP28300 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXP28300 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXP28300 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LOXP28300 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LOXP28300 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LOXP28300 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LOXP28300 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LOXP28300 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LOXP28300 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXP28300 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXP28300 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXP28300 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms