Protein–RNA interactions for Protein: P25367

RNQ1, [PIN+] prion protein RNQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1P25367 snR50snR50 90 nt2.1□□□□□ -2.07
RNQ1P25367 YEF3YLR249W 3135 nt2.09□□□□□ -2.07
RNQ1P25367 MDS3YGL197W 4464 nt2.09□□□□□ -2.07
RNQ1P25367 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.09□□□□□ -2.07
RNQ1P25367 SPF1YEL031W 3648 nt2.09□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 VPS13YLL040C 9435 nt2.08□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 UTP22YGR090W 3714 nt2.08□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 DNF1YER166W 4716 nt2.08□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 YJR039WYJR039W 3366 nt2.08□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 SLI15YBR156C 2097 nt2.08□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 TBS1YBR150C 3285 nt2.08□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 BUD2YKL092C 3315 nt2.07□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 TFC3YAL001C 3483 nt2.07□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 MSH5YDL154W 2706 nt2.07□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.07□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 YLR232WYLR232W 348 nt2.07□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 snR47snR47 99 nt2.07□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.05□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 ADR1YDR216W 3972 nt2.05□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 RTP1YMR185W 2946 nt2.04□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 VPS8YAL002W 3825 nt2.04□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 RSM22YKL155C 1887 nt2.04□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 ASE1YOR058C 2658 nt2.04□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 ORC3YLL004W 1851 nt2.03□□□□□ -2.08
RNQ1P25367 AGC1YPR021C 2709 nt2.02□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 POL5YEL055C 3069 nt2.02□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 FRK1YPL141C 2598 nt2.01□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.01□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 NUP157YER105C 4176 nt2□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 snR75snR75 89 nt2□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 YML002WYML002W 2214 nt2□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 AMS1YGL156W 3252 nt2□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 NUP100YKL068W 2880 nt1.99□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.99□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 GYP5YPL249C 2685 nt1.98□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 CDC60YPL160W 3273 nt1.98□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 UFD4YKL010C 4452 nt1.98□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.98□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.98□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 SEC21YNL287W 2808 nt1.98□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 MET18YIL128W 3099 nt1.97□□□□□ -2.09
RNQ1P25367 COA6YMR244C-A 315 nt1.96□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 YOL098CYOL098C 3114 nt1.95□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 CTR9YOL145C 3234 nt1.95□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 NOP9YJL010C 2001 nt1.95□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 CSF1YLR087C 8877 nt1.95□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 TOR1YJR066W 7413 nt1.95□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 TIM9YEL020W-A 264 nt1.95□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 SEY1YOR165W 2331 nt1.95□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 SSD1YDR293C 3753 nt1.94□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 TRM3YDL112W 4311 nt1.93□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 GEA1YJR031C 4227 nt1.93□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 YLR041WYLR041W 321 nt1.93□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 DGR1YNL130C-A 147 nt1.93□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 GCN2YDR283C 4980 nt1.93□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 PSD2YGR170W 3417 nt1.93□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 IRE1YHR079C 3348 nt1.91□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 BRE1YDL074C 2103 nt1.91□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 KIP1YBL063W 3336 nt1.91□□□□□ -2.1
RNQ1P25367 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.9□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 SEC10YLR166C 2616 nt1.9□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 TRS130YMR218C 3309 nt1.9□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 ALY2YJL084C 3141 nt1.9□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.9□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 UBR1YGR184C 5853 nt1.89□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 RAV1YJR033C 4074 nt1.89□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 PEP1YBL017C 4740 nt1.89□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 SEC16YPL085W 6588 nt1.89□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 TUS1YLR425W 3924 nt1.89□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 MMS4YBR098W 2076 nt1.89□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 RPM2YML091C 3609 nt1.89□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 SPP41YDR464W 4308 nt1.88□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 TRL1YJL087C 2484 nt1.88□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 YKL225WYKL225W 348 nt1.88□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 RPS29AYLR388W 171 nt1.88□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 REV3YPL167C 4515 nt1.88□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 RAD9YDR217C 3930 nt1.87□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 CHC1YGL206C 4962 nt1.87□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 KOG1YHR186C 4674 nt1.87□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 YPR097WYPR097W 3222 nt1.87□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 MYO2YOR326W 4725 nt1.86□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 RGA1YOR127W 3024 nt1.86□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 TOF1YNL273W 3717 nt1.86□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 SYH1YPL105C 2550 nt1.86□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 SEC31YDL195W 3822 nt1.86□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 SPO24YPR036W-A 204 nt1.86□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 SMC1YFL008W 3678 nt1.86□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 PET309YLR067C 2898 nt1.86□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 FAR11YNL127W 2862 nt1.85□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 UBP3YER151C 2739 nt1.85□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.85□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 STH1YIL126W 4080 nt1.85□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 PAN2YGL094C 3348 nt1.84□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 RPL26BYGR034W 384 nt1.84□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 GIP3YPL137C 3831 nt1.84□□□□□ -2.11
RNQ1P25367 TOR2YKL203C 7425 nt1.84□□□□□ -2.12
RNQ1P25367 TOP2YNL088W 4287 nt1.84□□□□□ -2.12
RNQ1P25367 BNI1YNL271C 5862 nt1.84□□□□□ -2.12
RNQ1P25367 AZF1YOR113W 2745 nt1.83□□□□□ -2.12
RNQ1P25367 WAR1YML076C 2835 nt1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.7 ms