Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FGFR3P22607 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGFR3P22607 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FGFR3P22607 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms