Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF3P20783 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTF3P20783 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF3P20783 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NTF3P20783 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms