Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNB1P20700 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms