Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGB6P18564 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms