Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN2P17655 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms