Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3L1P16619 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL3L1P16619 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms