Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPBP14678 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPBP14678 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms