Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB5P09067 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms