Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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