Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRCP08575 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRCP08575 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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