Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDHBP07195 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LDHBP07195 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDHBP07195 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDHBP07195 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDHBP07195 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDHBP07195 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDHBP07195 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDHBP07195 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDHBP07195 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDHBP07195 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LDHBP07195 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDHBP07195 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDHBP07195 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDHBP07195 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDHBP07195 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDHBP07195 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDHBP07195 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LDHBP07195 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDHBP07195 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDHBP07195 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LDHBP07195 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDHBP07195 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDHBP07195 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDHBP07195 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms