Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTMAP06454 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTMAP06454 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTMAP06454 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTMAP06454 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTMAP06454 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTMAP06454 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTMAP06454 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTMAP06454 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTMAP06454 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTMAP06454 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTMAP06454 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTMAP06454 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTMAP06454 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTMAP06454 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTMAP06454 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTMAP06454 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTMAP06454 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTMAP06454 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTMAP06454 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms