Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV1-17P01599 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGKV1-17P01599 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms