Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms