Protein–RNA interactions for Protein: O60684

KPNA6, Importin subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA6O60684 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA6O60684 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA6O60684 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms