Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNAB3O43448 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms