Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTIFO43310 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTIFO43310 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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