Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPAA1O43292 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms