Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAPO00193 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAPO00193 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAPO00193 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMAPO00193 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMAPO00193 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMAPO00193 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMAPO00193 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMAPO00193 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms