Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DIRC3C9JPN6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms