Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPDYE4A6NLX3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDYE4A6NLX3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms