Protein–RNA interactions for Protein: A4D1Z8

GRIFIN, Grifin, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIFINA4D1Z8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIFINA4D1Z8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIFINA4D1Z8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms