Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB19A4D1S5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms