Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 ARHGAP32-206ENST00000527272 5289 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 ALDH6A1-202ENST00000553458 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
C4BP0C0L5 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 ANKFN1-202ENST00000566473 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 CCDC113-202ENST00000443128 5110 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC138207.6-201ENST00000579164 1967 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
C4BP0C0L5 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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