Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMC9Q9Y3B6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMC9Q9Y3B6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms