Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms