Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms