Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RIMS3Q9UJD0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms