Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGNQ9P2M7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGNQ9P2M7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms