Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY12

GAR1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAR1Q9NY12 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GAR1Q9NY12 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms