Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD4L1Q9NU39 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms