Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
FZD3Q9NPG1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FZD3Q9NPG1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms