Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms