Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL3Q9H2J4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms