Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms