Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms