Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms